Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 ARHGEF10-204ENST00000398564 5480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 UBE3B-203ENST00000434735 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 SLC44A1-201ENST00000374720 10511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 CABIN1-203ENST00000398319 7480 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 NDST1-201ENST00000261797 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 SEC14L1-202ENST00000430767 5283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 TNS1-220ENST00000611415 6509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 LRRC8A-201ENST00000259324 4619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 MCM3AP-201ENST00000291688 6193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 CASP8AP2-205ENST00000551025 6151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 KIF14-201ENST00000367350 7274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms