Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ACTBP60709 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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