Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBASH3AP57075 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms