Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPOLAP51003 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPOLAP51003 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPOLAP51003 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPOLAP51003 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPOLAP51003 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPOLAP51003 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPOLAP51003 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPOLAP51003 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPOLAP51003 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPOLAP51003 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPOLAP51003 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPOLAP51003 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPOLAP51003 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPOLAP51003 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPOLAP51003 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPOLAP51003 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPOLAP51003 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPOLAP51003 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPOLAP51003 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPOLAP51003 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPOLAP51003 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPOLAP51003 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPOLAP51003 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPOLAP51003 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPOLAP51003 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPOLAP51003 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPOLAP51003 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPOLAP51003 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPOLAP51003 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPOLAP51003 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPOLAP51003 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPOLAP51003 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPOLAP51003 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPOLAP51003 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPOLAP51003 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPOLAP51003 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPOLAP51003 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAPOLAP51003 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms