Protein–RNA interactions for Protein: P49411

TUFM, Elongation factor Tu, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFMP49411 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUFMP49411 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUFMP49411 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUFMP49411 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUFMP49411 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUFMP49411 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUFMP49411 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUFMP49411 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms