Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NESP48681 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NESP48681 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NESP48681 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NESP48681 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NESP48681 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NESP48681 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NESP48681 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NESP48681 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NESP48681 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NESP48681 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NESP48681 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NESP48681 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NESP48681 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NESP48681 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NESP48681 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NESP48681 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NESP48681 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NESP48681 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NESP48681 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NESP48681 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NESP48681 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NESP48681 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NESP48681 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NESP48681 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NESP48681 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NESP48681 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NESP48681 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NESP48681 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NESP48681 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NESP48681 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NESP48681 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NESP48681 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NESP48681 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NESP48681 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NESP48681 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NESP48681 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NESP48681 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NESP48681 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NESP48681 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NESP48681 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NESP48681 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NESP48681 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NESP48681 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NESP48681 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NESP48681 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NESP48681 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NESP48681 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NESP48681 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NESP48681 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NESP48681 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NESP48681 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NESP48681 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NESP48681 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NESP48681 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NESP48681 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NESP48681 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NESP48681 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NESP48681 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NESP48681 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NESP48681 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NESP48681 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NESP48681 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NESP48681 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NESP48681 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NESP48681 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NESP48681 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NESP48681 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NESP48681 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NESP48681 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NESP48681 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NESP48681 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NESP48681 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NESP48681 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NESP48681 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NESP48681 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NESP48681 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NESP48681 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NESP48681 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NESP48681 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NESP48681 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NESP48681 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NESP48681 AC022447.5-201ENST00000504817 392 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NESP48681 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NESP48681 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NESP48681 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NESP48681 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NESP48681 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NESP48681 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NESP48681 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NESP48681 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NESP48681 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NESP48681 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NESP48681 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NESP48681 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NESP48681 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NESP48681 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NESP48681 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NESP48681 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NESP48681 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms