Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms