Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms