Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPARGP37231 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPARGP37231 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPARGP37231 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PPARGP37231 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPARGP37231 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PPARGP37231 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPARGP37231 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PPARGP37231 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PPARGP37231 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPARGP37231 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PPARGP37231 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PPARGP37231 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PPARGP37231 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PPARGP37231 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPARGP37231 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PPARGP37231 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PPARGP37231 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPARGP37231 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PPARGP37231 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPARGP37231 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PPARGP37231 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PPARGP37231 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPARGP37231 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PPARGP37231 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PPARGP37231 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPARGP37231 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PPARGP37231 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPARGP37231 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PPARGP37231 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PPARGP37231 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PPARGP37231 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PPARGP37231 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PPARGP37231 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PPARGP37231 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PPARGP37231 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PPARGP37231 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PPARGP37231 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms