Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms