Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POLD1P28340 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POLD1P28340 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLD1P28340 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLD1P28340 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLD1P28340 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLD1P28340 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLD1P28340 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLD1P28340 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POLD1P28340 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLD1P28340 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLD1P28340 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLD1P28340 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLD1P28340 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLD1P28340 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLD1P28340 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POLD1P28340 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLD1P28340 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLD1P28340 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLD1P28340 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POLD1P28340 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLD1P28340 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POLD1P28340 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLD1P28340 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLD1P28340 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLD1P28340 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLD1P28340 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLD1P28340 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLD1P28340 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLD1P28340 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLD1P28340 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLD1P28340 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLD1P28340 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLD1P28340 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLD1P28340 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLD1P28340 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD1P28340 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD1P28340 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD1P28340 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD1P28340 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD1P28340 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD1P28340 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD1P28340 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD1P28340 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD1P28340 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD1P28340 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD1P28340 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD1P28340 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD1P28340 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD1P28340 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD1P28340 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD1P28340 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD1P28340 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD1P28340 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD1P28340 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD1P28340 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD1P28340 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD1P28340 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD1P28340 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD1P28340 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD1P28340 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD1P28340 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD1P28340 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD1P28340 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD1P28340 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD1P28340 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD1P28340 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD1P28340 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD1P28340 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD1P28340 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD1P28340 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD1P28340 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
POLD1P28340 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms