Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 DGCR5-203ENST00000438934 5492 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 STRC-213ENST00000541030 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 PIK3CD-202ENST00000377346 5203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 SPTB-202ENST00000389720 6321 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PLNP26678 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms