Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCM3P25205 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCM3P25205 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCM3P25205 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCM3P25205 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCM3P25205 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCM3P25205 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCM3P25205 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCM3P25205 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCM3P25205 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCM3P25205 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCM3P25205 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCM3P25205 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCM3P25205 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCM3P25205 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MCM3P25205 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCM3P25205 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCM3P25205 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCM3P25205 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCM3P25205 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MCM3P25205 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCM3P25205 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCM3P25205 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCM3P25205 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCM3P25205 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCM3P25205 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCM3P25205 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MCM3P25205 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCM3P25205 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCM3P25205 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCM3P25205 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCM3P25205 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCM3P25205 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCM3P25205 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCM3P25205 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCM3P25205 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCM3P25205 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCM3P25205 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCM3P25205 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCM3P25205 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCM3P25205 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCM3P25205 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCM3P25205 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCM3P25205 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCM3P25205 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCM3P25205 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCM3P25205 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCM3P25205 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCM3P25205 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCM3P25205 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCM3P25205 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms