Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMD1P17707 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMD1P17707 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMD1P17707 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMD1P17707 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMD1P17707 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMD1P17707 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMD1P17707 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMD1P17707 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AMD1P17707 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMD1P17707 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMD1P17707 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMD1P17707 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AMD1P17707 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMD1P17707 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMD1P17707 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMD1P17707 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMD1P17707 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMD1P17707 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AMD1P17707 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMD1P17707 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMD1P17707 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMD1P17707 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMD1P17707 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMD1P17707 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMD1P17707 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMD1P17707 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMD1P17707 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMD1P17707 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMD1P17707 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMD1P17707 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMD1P17707 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AMD1P17707 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMD1P17707 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMD1P17707 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMD1P17707 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AMD1P17707 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AMD1P17707 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AMD1P17707 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AMD1P17707 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AMD1P17707 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AMD1P17707 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AMD1P17707 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AMD1P17707 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms