Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA1P17302 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA1P17302 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA1P17302 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA1P17302 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA1P17302 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA1P17302 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA1P17302 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA1P17302 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA1P17302 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA1P17302 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA1P17302 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA1P17302 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA1P17302 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA1P17302 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA1P17302 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA1P17302 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA1P17302 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA1P17302 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA1P17302 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA1P17302 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA1P17302 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA1P17302 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA1P17302 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA1P17302 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA1P17302 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA1P17302 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA1P17302 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA1P17302 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA1P17302 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA1P17302 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA1P17302 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA1P17302 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA1P17302 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GJA1P17302 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GJA1P17302 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GJA1P17302 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GJA1P17302 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GJA1P17302 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GJA1P17302 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GJA1P17302 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GJA1P17302 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GJA1P17302 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA1P17302 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA1P17302 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA1P17302 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms