Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BRAFP15056 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms