Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms