Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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TMEM225BP0DP42 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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TMEM225BP0DP42 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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