Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
F13BP05160 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
F13BP05160 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
F13BP05160 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
F13BP05160 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
F13BP05160 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
F13BP05160 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
F13BP05160 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
F13BP05160 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
F13BP05160 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
F13BP05160 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
F13BP05160 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
F13BP05160 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
F13BP05160 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
F13BP05160 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
F13BP05160 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
F13BP05160 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
F13BP05160 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
F13BP05160 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
F13BP05160 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
F13BP05160 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
F13BP05160 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
F13BP05160 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
F13BP05160 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
F13BP05160 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
F13BP05160 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
F13BP05160 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
F13BP05160 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
F13BP05160 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
F13BP05160 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
F13BP05160 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
F13BP05160 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
F13BP05160 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
F13BP05160 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
F13BP05160 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
F13BP05160 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
F13BP05160 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
F13BP05160 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
F13BP05160 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
F13BP05160 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
F13BP05160 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
F13BP05160 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
F13BP05160 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
F13BP05160 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
F13BP05160 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
F13BP05160 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
F13BP05160 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms