Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
F9P00740 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F9P00740 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F9P00740 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F9P00740 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F9P00740 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F9P00740 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F9P00740 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F9P00740 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F9P00740 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F9P00740 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F9P00740 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F9P00740 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F9P00740 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F9P00740 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F9P00740 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F9P00740 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F9P00740 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F9P00740 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F9P00740 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F9P00740 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
F9P00740 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F9P00740 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
F9P00740 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F9P00740 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F9P00740 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F9P00740 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F9P00740 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F9P00740 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F9P00740 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F9P00740 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F9P00740 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F9P00740 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F9P00740 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F9P00740 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F9P00740 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F9P00740 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F9P00740 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F9P00740 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F9P00740 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F9P00740 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F9P00740 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F9P00740 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F9P00740 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F9P00740 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms