Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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