Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG7O95352 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
ATG7O95352 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATG7O95352 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATG7O95352 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATG7O95352 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATG7O95352 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATG7O95352 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATG7O95352 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATG7O95352 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATG7O95352 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATG7O95352 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG7O95352 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG7O95352 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG7O95352 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG7O95352 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG7O95352 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG7O95352 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG7O95352 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG7O95352 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG7O95352 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG7O95352 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG7O95352 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG7O95352 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG7O95352 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG7O95352 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG7O95352 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG7O95352 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG7O95352 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG7O95352 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG7O95352 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG7O95352 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG7O95352 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG7O95352 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG7O95352 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG7O95352 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG7O95352 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG7O95352 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG7O95352 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG7O95352 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG7O95352 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG7O95352 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG7O95352 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG7O95352 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG7O95352 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG7O95352 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG7O95352 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG7O95352 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG7O95352 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG7O95352 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG7O95352 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms