Protein–RNA interactions for Protein: O95196

CSPG5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, humanhuman

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG5O95196 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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