Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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