Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM4A7MD48 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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