Protein–RNA interactions for Protein: A6XGL0

YJEFN3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YJEFN3A6XGL0 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YJEFN3A6XGL0 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms