Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms