Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.8 ms