Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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