Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM8

AP4E1, AP-4 complex subunit epsilon-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4E1Q9UPM8 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.8 ms