Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms