Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5BQ9UGL1 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms