Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms