Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERVK-5Q9HDB9 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVK-5Q9HDB9 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms