Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

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Length 1,115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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