Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms