Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms