Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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