Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms