Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 RPS6-201ENST00000315377 863 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ASPDH-201ENST00000376916 848 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 CSTF3-203ENST00000438862 1132 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC007690.1-201ENST00000451924 468 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC093627.3-201ENST00000467050 574 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 JPT1-205ENST00000470924 663 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 GIMAP6-202ENST00000493969 876 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC079340.2-201ENST00000504957 495 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC02507-201ENST00000509370 1028 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC027277.1-201ENST00000535363 533 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AP003170.2-201ENST00000544730 786 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms