Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RNF17Q9BXT8 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms