Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MTA3Q9BTC8 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms