Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

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Length 2,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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NOTCH4Q99466 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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NOTCH4Q99466 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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NOTCH4Q99466 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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