Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms