Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRIQ1Q96JM4 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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