Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
OTUB2Q96DC9 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.08■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.08■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.08■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.08■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.08■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
OTUB2Q96DC9 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms