Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms