Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms