Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 UMPS-201ENST00000232607 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 NLRP1-202ENST00000269280 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 FAM46A-202ENST00000369754 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 CAMTA2-202ENST00000361571 4777 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 DCLK3-203ENST00000636136 5446 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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COPS9Q8WXC6 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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COPS9Q8WXC6 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 SPTBN1-202ENST00000356805 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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