Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B8

RASGEF1A, Ras-GEF domain-containing family member 1A, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1AQ8N9B8 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1AQ8N9B8 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RASGEF1AQ8N9B8 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RASGEF1AQ8N9B8 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RASGEF1AQ8N9B8 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RASGEF1AQ8N9B8 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RASGEF1AQ8N9B8 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RASGEF1AQ8N9B8 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RASGEF1AQ8N9B8 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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RASGEF1AQ8N9B8 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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